More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2862 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  58.5 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  56.46 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  55.78 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  48.98 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  51.7 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  51.02 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  48.3 
 
 		 143 aa  141  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  48.3 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  46.26 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  46.94 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  46.94 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  46.48 
 
 		 143 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  44.9 
 
 		 145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  47.18 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  46.26 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  46.26 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  46.26 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  46.94 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  47.62 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  44.22 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  45.77 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  47.62 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  44.22 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  43.54 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  45.58 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  43.54 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3680  universal stress protein  43.54 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  37.82 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  40.85 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  39.44 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.97 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  37.93 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  36.62 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  36.91 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.21 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  39.16 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  33.77 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  34.44 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  33.56 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 162 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  30.82 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.17 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  32.43 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  28.48 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  28.87 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  32.88 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  33.33 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  31.13 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  32.87 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.99 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.99 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.28 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  31.76 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.76 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.87 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  34.51 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  28.67 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  30.41 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.47 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.47 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  31.33 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  31.33 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  26.57 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  29.66 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  31.03 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  31.16 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.87 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  32.39 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.17 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  27.89 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  27.81 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  27.33 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  28.67 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  27.97 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  30.34 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  30.34 
 
 		 306 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  29.14 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  28.28 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  30.14 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  29.14 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>