More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1118 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  89.19 
 
 		 149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  71.43 
 
 		 147 aa  224  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  65.52 
 
 		 147 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  62.59 
 
 		 151 aa  206  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  63.45 
 
 		 147 aa  206  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  61.22 
 
 		 151 aa  203  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  67.35 
 
 		 148 aa  203  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  44.52 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  43.05 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  40.41 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 147 aa  105  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  41.78 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  39.04 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.86 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 308 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  36.43 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  33.09 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  37.5 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.87 
 
 		 208 aa  94.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  32.37 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  34.01 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.57 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.93 
 
 		 288 aa  90.9  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  34.01 
 
 		 153 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.86 
 
 		 290 aa  90.5  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  34.01 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35.81 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  36.55 
 
 		 164 aa  89.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  37.41 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  35.48 
 
 		 304 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  36.11 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  30.5 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  38.03 
 
 		 303 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 308 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  39.04 
 
 		 164 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  37.01 
 
 		 280 aa  87  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  32.41 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.46 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  37.93 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  36.31 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.62 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  35.62 
 
 		 307 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  33.57 
 
 		 207 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  37.32 
 
 		 305 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.24 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.24 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.81 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  32.62 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  37.93 
 
 		 320 aa  84  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  36.31 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 162 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  35.53 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.89 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  34 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  34.25 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  34.93 
 
 		 300 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  31.97 
 
 		 285 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.11 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  30.34 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  36.49 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  32.43 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  34.27 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  36.05 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  31.79 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  31.79 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  32.89 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  34.97 
 
 		 415 aa  78.2  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  30.28 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>