More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0315 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 146 aa  285  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  64.83 
 
 		 148 aa  181  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  44.06 
 
 		 147 aa  90.5  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  43.97 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  45.07 
 
 		 339 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  45.07 
 
 		 277 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  42.96 
 
 		 305 aa  84  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  42.75 
 
 		 291 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  42.03 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 296 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  40.29 
 
 		 294 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  40.29 
 
 		 294 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  40.29 
 
 		 294 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  41.38 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  39.31 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  41.55 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  42.57 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  42.14 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  39.44 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  38.78 
 
 		 347 aa  74.7  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  37.66 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  38.73 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 293 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  41.26 
 
 		 293 aa  73.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 		 289 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 		 295 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  39.29 
 
 		 295 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 		 295 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 		 294 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  39.16 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  37.96 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  38.1 
 
 		 317 aa  72  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.67 
 
 		 292 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  41.01 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  39.86 
 
 		 294 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  37.23 
 
 		 341 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  40.41 
 
 		 321 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 294 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 		 341 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  39.01 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  36.3 
 
 		 303 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  39.44 
 
 		 282 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 294 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  34.93 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  36.23 
 
 		 294 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  40.85 
 
 		 307 aa  70.5  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  40.38 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.88 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  34.97 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  34.97 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  34.48 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.88 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 		 288 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  38.13 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  42.76 
 
 		 393 aa  68.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  32.65 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4449  hypothetical protein  36.91 
 
 		 311 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  39.31 
 
 		 313 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  34.75 
 
 		 298 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 343 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 298 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 298 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  39.04 
 
 		 303 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  41.55 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 289 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  33.91 
 
 		 381 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 287 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  39.29 
 
 		 273 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  37.32 
 
 		 283 aa  67  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 		 276 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 		 294 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  40.69 
 
 		 309 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  40.82 
 
 		 291 aa  66.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  36.99 
 
 		 294 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  33.58 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.43 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  37.41 
 
 		 306 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  37.58 
 
 		 308 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  36.99 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  36.84 
 
 		 277 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>