More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0489 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  313  6e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  41.03 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  42.11 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  41.45 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 147 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  41.45 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  39.47 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  40.79 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 143 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  40.79 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  40.13 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  37.82 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  36.94 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  35.26 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  35.67 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3680  universal stress protein  32.69 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.41 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.77 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.07 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.48 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.29 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.33 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.72 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  28.12 
 
 		 515 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.76 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.61 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.73 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  33.54 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.85 
 
 		 304 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  30.61 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.72 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  28.95 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  25.64 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  28.95 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  26.49 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  32.48 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  30.06 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.57 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.57 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  26.49 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 274 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  27.5 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  27.89 
 
 		 289 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  29.03 
 
 		 169 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 163 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  30 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  30.52 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.25 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  29.3 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  28.03 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.29 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  32.67 
 
 		 296 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  28.08 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  25.66 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  27.11 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  28.67 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  26.75 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  32.05 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  28.66 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  26.75 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.21 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>