More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1199 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 515 aa  1043    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2603  Bile acid:sodium symporter  71.21 
 
 		 325 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000713647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1411  sodium/bile acid symporter family protein  68.56 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.618786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1293  Bile acid:sodium symporter  62.88 
 
 		 327 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0197  bile acid:sodium symporter  59.52 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0279028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0627  bile acid:sodium symporter  59.88 
 
 		 333 aa  368  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1578  arsenite efflux pump ACR3 and related permeases  57.72 
 
 		 323 aa  352  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0408  sodium/bile acid symporter family protein  54.29 
 
 		 325 aa  336  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1934  bile acid:sodium symporter  57.45 
 
 		 324 aa  336  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000370816  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2303  Bile acid:sodium symporter  53.47 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000645275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03690  Bile acid:sodium symporter  37.66 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  33.86 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0693  Bile acid:sodium symporter  33.22 
 
 		 338 aa  126  8.000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  38.79 
 
 		 168 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0172  Bile acid:sodium symporter  26.71 
 
 		 328 aa  94.7  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0310359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  29.73 
 
 		 352 aa  90.5  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 389 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  28.7 
 
 		 350 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1733  arsenical-resistance protein, putative  25.48 
 
 		 347 aa  88.6  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  28.94 
 
 		 321 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  28.94 
 
 		 321 aa  87.4  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  25.55 
 
 		 377 aa  87.4  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  28.94 
 
 		 321 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  28.94 
 
 		 321 aa  87  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  28.94 
 
 		 321 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  25.78 
 
 		 357 aa  86.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  26.23 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1026  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  27.76 
 
 		 354 aa  86.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000872281  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  25.67 
 
 		 351 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  26.56 
 
 		 346 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  27.84 
 
 		 321 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  26.56 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  25.67 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  25.67 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  26.56 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  26.12 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  26.88 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  28.57 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  28.57 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  26.56 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  26.56 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  26.56 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  26.74 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0818  hypothetical protein  27.97 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  26.56 
 
 		 346 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  26.25 
 
 		 346 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  25.29 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  27.04 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  28.52 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  26.8 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  24.53 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  27.17 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  27.63 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0334  arsenical-resistance protein  30.58 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1054  arsenical-resistance protein  25.57 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0721949  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  26.39 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  27.63 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  24.38 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  25.85 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  25.39 
 
 		 369 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  24.61 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  26.74 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  26.26 
 
 		 328 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  24.06 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  25.57 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  22.77 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  23.27 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  22.78 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  25.19 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4003  bile acid:sodium symporter  27.82 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.656396  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  23.46 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  25.29 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  25.95 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  23.99 
 
 		 371 aa  76.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  26.28 
 
 		 355 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  25.38 
 
 		 357 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31170  arsenical-resistance protein  26.26 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  27.34 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  31.87 
 
 		 145 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  26.43 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3333  arsenical-resistance protein  26.55 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  23.38 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1933  arsenical-resistance protein  28.06 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2321  arsenical-resistance protein  24.29 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  28.65 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  22.53 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  25.15 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2372  arsenical-resistance protein  24.29 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000347723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  26.04 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  23.99 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0212  arsenical-resistance protein  24.77 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  24.69 
 
 		 356 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  23.15 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  26.43 
 
 		 362 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0756  arsenical-resistance protein  26.71 
 
 		 350 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.442454  hitchhiker  0.00390365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  26.18 
 
 		 378 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  28.48 
 
 		 159 aa  72.8  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  25.1 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  23.08 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  24.31 
 
 		 350 aa  72.8  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>