More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4083 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 172 aa  350  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  41.18 
 
 		 153 aa  96.7  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  38.03 
 
 		 142 aa  88.2  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.37 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  33.11 
 
 		 153 aa  85.1  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  35.76 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.77 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2379  UspA domain protein  33.12 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.54331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  34.48 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.01 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  32.5 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.17 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  36.24 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.8 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.77 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  29.79 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.82 
 
 		 320 aa  70.9  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  31.29 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0547  UspA domain protein  31.97 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.82 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.8 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.46 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.14 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  30.5 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.25 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  31.33 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.14 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.07 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.37 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.25 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.9 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.87 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.87 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  31.47 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.46 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.51 
 
 		 290 aa  65.1  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  30.71 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  37.5 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  27.97 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  30.52 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  32.89 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  29.87 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  33.81 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  27.97 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  31.65 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  27.15 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  27.97 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  29.37 
 
 		 140 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  28.87 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  29.93 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  31.69 
 
 		 325 aa  61.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  35.21 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.34 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  34.27 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  56.86 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  32.67 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  32.17 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  34.03 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  30.56 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  30.07 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  33.09 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  30.07 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  35.17 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  30.07 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  30.07 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 		 750 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  33.57 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  30.07 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  30.52 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  28.47 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.07 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  30.71 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>