More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2196 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  286  5.0000000000000004e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  58.99 
 
 
148 aa  168  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  49.31 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  42.76 
 
 
150 aa  127  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  42.07 
 
 
150 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  44.22 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  38.62 
 
 
150 aa  114  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  44.12 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  42.38 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  40.44 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  39.58 
 
 
157 aa  104  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.69 
 
 
180 aa  104  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  41.3 
 
 
164 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  42.36 
 
 
148 aa  101  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  40.15 
 
 
145 aa  100  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  41.91 
 
 
158 aa  100  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  41.3 
 
 
149 aa  100  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  39.42 
 
 
145 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  38.57 
 
 
159 aa  97.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  39.42 
 
 
145 aa  97.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  38.69 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  40.44 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  38.97 
 
 
165 aa  92.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
157 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 
147 aa  90.1  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.04 
 
 
208 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.97 
 
 
290 aa  88.2  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  37.93 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  35.77 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 
142 aa  87  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  37.84 
 
 
157 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  40.54 
 
 
173 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  38.41 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  32.85 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  41.55 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.46 
 
 
144 aa  84  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  39.73 
 
 
154 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
162 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  34.53 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.49 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.33 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  36 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.36 
 
 
200 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  37.5 
 
 
305 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  34.53 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  34.53 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  34.53 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  34.53 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  34.53 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  34.53 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  34.53 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  34.53 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  34.53 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  36.67 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.69 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.76 
 
 
320 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  35.97 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.31 
 
 
307 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  35.46 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.86 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.54 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  38.36 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.22 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  36.09 
 
 
280 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  36.49 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  38.57 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.1 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  36.05 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.36 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  34.51 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  36.17 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  32.39 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  32.17 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  35.66 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  34.53 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  35.66 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  33.57 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>