More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1445 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  100 
 
 
162 aa  323  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  88.27 
 
 
162 aa  283  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  87.04 
 
 
162 aa  279  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  53.42 
 
 
162 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  55.17 
 
 
164 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  51.53 
 
 
164 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  53.1 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  48.15 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  53.79 
 
 
164 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  48.61 
 
 
151 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  46.85 
 
 
153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  46.15 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  46.85 
 
 
153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 
137 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  46.98 
 
 
155 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  42.28 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  40.27 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  40 
 
 
153 aa  97.1  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  39.04 
 
 
145 aa  95.5  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3093  UspA domain-containing protein  48.61 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  37.67 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2501  UspA domain protein  44.37 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  38.62 
 
 
150 aa  91.7  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  38.46 
 
 
152 aa  90.9  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
145 aa  90.9  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  38.36 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  39.31 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  38.89 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.27 
 
 
150 aa  87  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  34.51 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2414  UspA domain protein  45.14 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  37.5 
 
 
320 aa  86.3  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.42 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  39.29 
 
 
134 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  39.29 
 
 
134 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  41.55 
 
 
143 aa  84.7  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  37.01 
 
 
212 aa  84.3  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  38.57 
 
 
134 aa  84  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  35.57 
 
 
147 aa  84  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  38.93 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  40.13 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  36.6 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  38.93 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  36.02 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.71 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  35.62 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  39.58 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  35.46 
 
 
289 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.25 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.93 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.24 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  36.54 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  39.6 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  42.41 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  38.41 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  35.95 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.56 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  38.06 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  33.74 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1446  universal stress protein UspA  40.51 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  35.1 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  35.57 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  36.71 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  39.29 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  33.57 
 
 
288 aa  77.4  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35.92 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  35.58 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  34.18 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  39.01 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.67 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  32.92 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  35 
 
 
305 aa  77  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  35.62 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  35.62 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  35.62 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  35.62 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  35.62 
 
 
155 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  33.78 
 
 
146 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  35.62 
 
 
155 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  34.42 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  42.47 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  36.2 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  41.13 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 
147 aa  77  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  35.46 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  35.81 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  36.13 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>