More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2564 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  100 
 
 		 282 aa  557  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  49.09 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  39.86 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  40.07 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.25 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  31.21 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  27.59 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.94 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2471  UspA domain protein  27.96 
 
 		 283 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584159  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  29.11 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  32.76 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  27.12 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.43 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  28.97 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  50.59 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.57 
 
 		 164 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  48.24 
 
 		 145 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 145 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35 
 
 		 150 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  26.64 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 145 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.94 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  47.06 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  26.64 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.85 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  36.32 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  30.23 
 
 		 341 aa  75.9  0.0000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  30.42 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  36.43 
 
 		 154 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.91 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  33.17 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.86 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  28.06 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  34.06 
 
 		 155 aa  72  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  37.04 
 
 		 154 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  38.58 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  37.41 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  24.59 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  37.32 
 
 		 148 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  34.33 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  37.14 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.62 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.87 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  26.5 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  51.52 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  31.29 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  29.73 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.66 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  32.35 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  33.57 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  27.62 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  31.88 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  28.28 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  21.83 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.29 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  21.95 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  29.55 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  33.33 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  21.53 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  31.63 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  23.92 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  26.43 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  31.96 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.58 
 
 		 151 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  26.15 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  27.27 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  27.27 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 341 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  27.27 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  26.6 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  29.77 
 
 		 390 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30.5 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  28.18 
 
 		 273 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  32.89 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  26.47 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  48.48 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  32.11 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.37 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  29.5 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  27.5 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  27.27 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.41 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  26.15 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.58 
 
 		 180 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  31.07 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  33.58 
 
 		 141 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  27.76 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  42.53 
 
 		 162 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>