More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_3017 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  100 
 
 
281 aa  546  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  47.77 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  43.4 
 
 
288 aa  201  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  40 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  43.49 
 
 
286 aa  175  9e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  41.24 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  38.19 
 
 
287 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  40.07 
 
 
283 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  37.58 
 
 
301 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.99 
 
 
300 aa  152  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  37.01 
 
 
415 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  41.49 
 
 
280 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  35.35 
 
 
307 aa  139  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  34.12 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.67 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  35.69 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  32.19 
 
 
301 aa  109  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  46.56 
 
 
208 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  33.66 
 
 
305 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
297 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  45.07 
 
 
152 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  40.29 
 
 
207 aa  102  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  45.32 
 
 
144 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  40 
 
 
155 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  41.36 
 
 
169 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  31.21 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  29.83 
 
 
297 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  48.23 
 
 
152 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  35.54 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  33.33 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  45.65 
 
 
144 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  42.95 
 
 
180 aa  95.9  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.9 
 
 
291 aa  95.5  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
449 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  31.99 
 
 
390 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  33.78 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  47.1 
 
 
158 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  30.55 
 
 
325 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  41.22 
 
 
153 aa  92.8  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  45.59 
 
 
145 aa  92.4  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
291 aa  92  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  27.99 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  39.04 
 
 
159 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  43.8 
 
 
141 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  29.61 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  31.34 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  40.58 
 
 
147 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  43.8 
 
 
159 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  40 
 
 
136 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  30.95 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  40.85 
 
 
150 aa  87  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.22 
 
 
274 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.21 
 
 
150 aa  86.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  25.86 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  30.04 
 
 
317 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.49 
 
 
156 aa  85.9  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  31.06 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  38.69 
 
 
147 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  38.82 
 
 
156 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  25.43 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.17 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  25 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  32.17 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  36.43 
 
 
149 aa  82  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  42.47 
 
 
148 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  25.59 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  24.83 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  43.8 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  29.63 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  34.86 
 
 
280 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  42.07 
 
 
138 aa  79  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  22.9 
 
 
276 aa  79  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  27.99 
 
 
282 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  31.49 
 
 
281 aa  79  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.72 
 
 
164 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 
145 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  31.23 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  34.69 
 
 
149 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.93 
 
 
150 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  39.72 
 
 
153 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  42.86 
 
 
133 aa  77  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.04 
 
 
150 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.9 
 
 
151 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  37.93 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  30.05 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  29.77 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.91 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  29.17 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  41.41 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  31.11 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  40.56 
 
 
151 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  27.83 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  30.27 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  30.88 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>