More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3794 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  100 
 
 
301 aa  603  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 
297 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  34.54 
 
 
297 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  31.97 
 
 
390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
317 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.56 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  29.97 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  32.57 
 
 
449 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  32.14 
 
 
306 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  30.89 
 
 
325 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  31.49 
 
 
415 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  26.42 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  27.69 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  25.08 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.05 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.63 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  30.16 
 
 
324 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.65 
 
 
304 aa  92.4  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  25.08 
 
 
287 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.67 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  27.87 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  27.55 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  30.05 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.03 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.81 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  26.53 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  30.93 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  26.99 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.67 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  24.57 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  32.45 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  27.6 
 
 
280 aa  79  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  27.42 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  28.67 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  28.67 
 
 
293 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  34.01 
 
 
151 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.04 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  26.97 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.47 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  31.16 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  28.07 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  27.33 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
145 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.68 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.54 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  27.95 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.34 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  30.26 
 
 
145 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  27.94 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  20.63 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  28.57 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  31.68 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  31.4 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  26.73 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  26.71 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  29.7 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  25.97 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  26.96 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  25.67 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.28 
 
 
147 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.79 
 
 
159 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  32.41 
 
 
152 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  25.58 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 
145 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  29.72 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 
145 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  25.66 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.57 
 
 
157 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.29 
 
 
158 aa  63.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  26.45 
 
 
145 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  26.45 
 
 
145 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  28.06 
 
 
297 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.33 
 
 
155 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  30.56 
 
 
144 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  33.78 
 
 
154 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  29.55 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  24.66 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1172  UspA domain protein  30.17 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.33 
 
 
180 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 
164 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  27.71 
 
 
156 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  29.68 
 
 
169 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  27.86 
 
 
145 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  31.97 
 
 
187 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
156 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.61 
 
 
140 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  27.67 
 
 
157 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  26.9 
 
 
142 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  30 
 
 
158 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  30.26 
 
 
145 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  26.37 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  26.33 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  27.72 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  28.33 
 
 
317 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  23.76 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>