More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1166 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  100 
 
 		 283 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  60.21 
 
 		 284 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  60.21 
 
 		 284 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  59.51 
 
 		 284 aa  345  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  63.38 
 
 		 284 aa  342  5.999999999999999e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  57.04 
 
 		 285 aa  328  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  55.83 
 
 		 283 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  53.02 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  50.53 
 
 		 283 aa  298  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  53.21 
 
 		 285 aa  292  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  56.54 
 
 		 283 aa  289  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  48.06 
 
 		 281 aa  282  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  49.82 
 
 		 281 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  50.35 
 
 		 284 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  46.29 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  49.47 
 
 		 284 aa  251  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  41.75 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  41.75 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  41.75 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 		 284 aa  219  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  39.36 
 
 		 287 aa  215  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  42.2 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  41.84 
 
 		 288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  40.57 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  40.21 
 
 		 283 aa  205  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  37.76 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  39.37 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  35.94 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  35.94 
 
 		 281 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  41.05 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  35.82 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  31.36 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  29.51 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  30.14 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  28.67 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  30.39 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  27.43 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  23.63 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  17.38 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  31.5 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  29.03 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  30.65 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  35.96 
 
 		 126 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  27.41 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  29.61 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  23.89 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  28.74 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  28.05 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.41 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  34.72 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  26.7 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  26.7 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  33.86 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  31.76 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  31.52 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.11 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  30.91 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  25.76 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  30.67 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  30.39 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  24.66 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  28.31 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  29.02 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  29.31 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  27.27 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  27.01 
 
 		 140 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  30.87 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  31.08 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  38.1 
 
 		 136 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  30.2 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.67 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  24.63 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  25.36 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  25.15 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  30.13 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  33.09 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  23.69 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  25 
 
 		 144 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  23.81 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  31.08 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  28.72 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  27.16 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 140 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  27.41 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  30.14 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  29.24 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  31.21 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  28.67 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 140 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>