More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0260 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  100 
 
 		 278 aa  566  1e-160  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  28.83 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  29.37 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  29.08 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 283 aa  135  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  29.08 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  29.08 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  29.08 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  29.27 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  26.07 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  29.39 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  28.07 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  27.92 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  29.58 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  26.5 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  25.78 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  25.7 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  27.27 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  24.3 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  24.47 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  26.15 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  24.11 
 
 		 286 aa  106  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  25.26 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  24.82 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  25.09 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  25.09 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  23.57 
 
 		 284 aa  94  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  26.99 
 
 		 307 aa  92  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  22.18 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  22.18 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  26.09 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  22.5 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  25.87 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  26.92 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  20.91 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  23.93 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  27.07 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  22.11 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.67 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  22.22 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  26.54 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  22.37 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  22.46 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  24.42 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  22.95 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  22.69 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  25.17 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  27.59 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  23.29 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.86 
 
 		 164 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  26.17 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  25.95 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  26.87 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  24.17 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  21.65 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  22.1 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  20.7 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  24.22 
 
 		 128 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  21.02 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  27.34 
 
 		 150 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  24.39 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  28.49 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  25.48 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  26.85 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.62 
 
 		 150 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  27.01 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  30 
 
 		 144 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  22.5 
 
 		 317 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  25.38 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  26.26 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  24.26 
 
 		 138 aa  53.1  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  25.18 
 
 		 140 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  24.69 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  26.26 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  24.43 
 
 		 136 aa  52.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  27.34 
 
 		 140 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  26.56 
 
 		 128 aa  52.8  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  21.65 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 140 aa  52.4  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  22.19 
 
 		 317 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  25.32 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  25.95 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 		 139 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  23.94 
 
 		 144 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  23.12 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  20.14 
 
 		 141 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  25.9 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  25.93 
 
 		 147 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.57 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>