79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1852 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  50.53 
 
 		 283 aa  298  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  50.35 
 
 		 284 aa  285  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  49.65 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  49.65 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  48.59 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  51.76 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  46.29 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  43.46 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  45.91 
 
 		 285 aa  248  6e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  47.7 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  43.93 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  46.79 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  43.82 
 
 		 281 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  43.11 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  45.42 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  37.46 
 
 		 287 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  37.46 
 
 		 287 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  37.46 
 
 		 287 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  36.75 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  35.34 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  36.27 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  35.82 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  33.8 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  33.57 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  34.62 
 
 		 281 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  34.15 
 
 		 283 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  26.24 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  28.01 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  25.53 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  27.37 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  22.65 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  32.56 
 
 		 126 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  24.13 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  29.49 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.03 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  19.03 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  27.74 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.12 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  23.39 
 
 		 282 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  23.87 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.6 
 
 		 274 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  32.88 
 
 		 136 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2379  UspA domain protein  28.74 
 
 		 163 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.54331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  25.53 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  24.12 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  25.93 
 
 		 139 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  29.58 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  21.77 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  28.57 
 
 		 144 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  27.06 
 
 		 169 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  27.27 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  22.58 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3300  UspA domain protein  24.05 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176121  normal  0.0128083 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  21.77 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  25.93 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  24.22 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  21.9 
 
 		 141 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  25.97 
 
 		 120 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  21.74 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  24.32 
 
 		 140 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  31.58 
 
 		 161 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  24.05 
 
 		 152 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  22.92 
 
 		 156 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.76 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  28.99 
 
 		 118 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  33.33 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  25.5 
 
 		 164 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  45.71 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  23.53 
 
 		 150 aa  42.4  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  23.11 
 
 		 283 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  27.16 
 
 		 140 aa  42.4  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>