More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1017 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  100 
 
 
138 aa  273  6e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
148 aa  90.9  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  38.3 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.1 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.03 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.27 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.94 
 
 
156 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  32.17 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.93 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.43 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.04 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.21 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  34.97 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.73 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  36.3 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  34.72 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  34.01 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  37.78 
 
 
137 aa  77  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.76 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  32.43 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  34.72 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.37 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  34.9 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  33.11 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.03 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.69 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  33.57 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  32.65 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  35.17 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.86 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.94 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.25 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.01 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.21 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  34.03 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  29.61 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  35.25 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  30.94 
 
 
208 aa  70.5  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  29.58 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.08 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  34.06 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  28.95 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  29.58 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  29.58 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  29.58 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  29.58 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  29.58 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  33.82 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  28.29 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  31.97 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.22 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  32.65 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.65 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  30.15 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  32.65 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  27.4 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  33.56 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.8 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.48 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  33.33 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.8 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  33.33 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.65 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  33.82 
 
 
283 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  30.26 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  32.12 
 
 
294 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  33.33 
 
 
162 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  32.19 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  29.08 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  33.1 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  30.71 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  34.9 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>