More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3808 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  100 
 
 
147 aa  289  8e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  51.68 
 
 
155 aa  138  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1686  UspA domain protein  41.18 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00978672  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  35.76 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  36.67 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  35.1 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  34.67 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  33.33 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  34.46 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.78 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  34.9 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  35.44 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  34.23 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.46 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.51 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.41 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.38 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  34.46 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  36.67 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  33.56 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.91 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
148 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.14 
 
 
290 aa  63.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.97 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.54 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  34.25 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.82 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.61 
 
 
288 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.01 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  30.82 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  32.43 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.53 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  32.19 
 
 
295 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  31.97 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.21 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  36.42 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  30.34 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  27.03 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  31.54 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  27.1 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.82 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  31.33 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  31.97 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.51 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.7 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  32.89 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  32.89 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.65 
 
 
208 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  35.14 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  34.03 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  30.52 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  36.49 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  36.49 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  34 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  30.2 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  27.03 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  32.65 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  41.33 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  34.9 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  29.53 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  30.82 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  26.8 
 
 
180 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.93 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  30.2 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  36.49 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  31.08 
 
 
288 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  27.7 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.19 
 
 
299 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.21 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  31.37 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  33.11 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
293 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  30.97 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.43 
 
 
288 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  27.21 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  32.45 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  28.19 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  29.05 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>