More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1686 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1686  UspA domain protein  100 
 
 		 141 aa  277  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00978672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  41.18 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  38.16 
 
 		 155 aa  86.7  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  36.49 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.88 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  33.56 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  32.14 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 294 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.94 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  32.17 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.25 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.47 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.43 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  33.79 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.8 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  33.1 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  31.21 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  29.79 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  30.14 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  34.25 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1409  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  40.26 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108766  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  32.47 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  43.94 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  35.21 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  36.9 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  46.15 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  28.87 
 
 		 341 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 341 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  29.17 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 341 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  32.64 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  35.06 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  32.19 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  31.43 
 
 		 287 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  37.86 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.45 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  28.95 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  34.93 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  29.08 
 
 		 295 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 295 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 295 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  31.25 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  28.87 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  31.29 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  32.62 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.72 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  34.97 
 
 		 298 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  28.67 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 298 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  31.25 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 298 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  26.76 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  35.23 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  26.76 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.22 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.53 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.43 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.82 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.14 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.25 
 
 		 149 aa  50.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  27.66 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  30.94 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.34 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.51 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  34.04 
 
 		 295 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  33.09 
 
 		 313 aa  50.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  29.37 
 
 		 295 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  33.57 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  28.87 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2937  UspA domain protein  33.09 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  24.65 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  32.64 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.97 
 
 		 300 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  26.92 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  34.51 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.37 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  30.41 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  33.11 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  33.57 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  31.65 
 
 		 294 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  27.97 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>