More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1249 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  313  4e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.21 
 
 
139 aa  84  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.89 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.41 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.67 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.07 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.45 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30.2 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.87 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  30.32 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  29.49 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  26.49 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  32.45 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.45 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  30.87 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.76 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.41 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  29.61 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  28.76 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  31.79 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  30.97 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  29.73 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  27.81 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  27.81 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  27.81 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  27.81 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  26.35 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.95 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  27.81 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  30 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  30.97 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  28.39 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  30.13 
 
 
303 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.61 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  27.52 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  27.52 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  25.5 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.66 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  29.66 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  27.33 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  27.52 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  34.21 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  28.38 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  27.56 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  31.29 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  29.03 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  29.8 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.15 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  29.05 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30 
 
 
304 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  28.39 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  30.67 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  27.33 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  28.21 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  29.14 
 
 
300 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  27.03 
 
 
283 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  26.45 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  25 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  30.67 
 
 
308 aa  60.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  24.53 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  33.11 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  30.72 
 
 
314 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.03 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  27.03 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  28.19 
 
 
303 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.13 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  42.37 
 
 
217 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.19 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  28 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  26.67 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  27.85 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  31.03 
 
 
317 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.13 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.39 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  26.28 
 
 
515 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  27.39 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.38 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>