More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3615 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  100 
 
 
176 aa  350  8e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  44.85 
 
 
138 aa  101  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  42.14 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  44.29 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  41.43 
 
 
139 aa  93.2  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  41.84 
 
 
150 aa  92.8  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  43.57 
 
 
141 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  42.14 
 
 
142 aa  90.5  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  35.37 
 
 
149 aa  88.2  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  40.43 
 
 
136 aa  87.4  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  43.88 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  43.48 
 
 
137 aa  85.9  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  35.14 
 
 
142 aa  85.1  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  38.69 
 
 
139 aa  84.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  37.86 
 
 
147 aa  84.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  38.89 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  37.5 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  40.14 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  39.57 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.59 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  35.51 
 
 
139 aa  80.5  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  39.01 
 
 
145 aa  80.5  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  38.73 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.85 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  37.96 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  39.42 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  35.21 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  36.05 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  37.24 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  37.24 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  38.26 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  32.61 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  32.69 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.79 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  36.22 
 
 
294 aa  68.2  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  37.24 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36.17 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  32.86 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  49.18 
 
 
290 aa  64.7  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  34.51 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  33.08 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.39 
 
 
152 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  31.58 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  46.77 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  37.84 
 
 
164 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  35.62 
 
 
146 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  31.11 
 
 
157 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.71 
 
 
128 aa  62  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.52 
 
 
150 aa  61.6  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  44.29 
 
 
150 aa  61.6  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 
148 aa  61.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  50 
 
 
288 aa  61.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
139 aa  61.2  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  46.67 
 
 
147 aa  60.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.33 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  47.54 
 
 
143 aa  60.5  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.37 
 
 
148 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  30.6 
 
 
157 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  37.84 
 
 
130 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  38.41 
 
 
415 aa  59.3  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  42.62 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  43.33 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
297 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  47.37 
 
 
143 aa  58.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.35 
 
 
145 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  36.99 
 
 
139 aa  58.5  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  42.37 
 
 
152 aa  58.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 
151 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  27.34 
 
 
145 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  45 
 
 
153 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  45 
 
 
153 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 
145 aa  57.4  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  43.06 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  43.33 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  41.54 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  32.14 
 
 
295 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  32.56 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  32.56 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
291 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  35.56 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1409  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
152 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 
297 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  37.89 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  44.87 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  29.37 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.03 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  27.59 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  33.61 
 
 
164 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  31.43 
 
 
138 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  33.61 
 
 
164 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  27.34 
 
 
150 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  30.83 
 
 
286 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  43.75 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  46.43 
 
 
217 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.33 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>