More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1585 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  100 
 
 		 142 aa  282  9e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  47.3 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  41.55 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  35.92 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  34.48 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  39.44 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  40.82 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  41.26 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  39.16 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  39.31 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  40.85 
 
 		 145 aa  84.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  36.99 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  37.16 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  36.17 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  37.67 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  40.69 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  40.54 
 
 		 320 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  34.03 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.27 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  39.44 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  35.46 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  36.36 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  36.99 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  33.79 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  36.81 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  35.62 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  35.62 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  37.06 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  38.46 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  38.46 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  38.46 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  35.62 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  33.8 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  38.3 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  32.39 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  34.48 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  33.33 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  34.23 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  38.51 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  38.51 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.1 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  34.72 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  36.3 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.88 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.12 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.43 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  33.57 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  33.57 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.25 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.26 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  29.61 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  33.57 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.8 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  34.39 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.99 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.56 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  30.5 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  34.03 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.28 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  30.92 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1409  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.21 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  28.87 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.5 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  29.08 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  29.08 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  29.08 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  29.08 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  33.54 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  29.08 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>