More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1343 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  100 
 
 
139 aa  279  8.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  64.03 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  59.71 
 
 
139 aa  174  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  62.41 
 
 
141 aa  174  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  55.71 
 
 
142 aa  149  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  43.36 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  43.88 
 
 
145 aa  106  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  41.38 
 
 
144 aa  102  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  42.34 
 
 
138 aa  101  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  41.61 
 
 
138 aa  100  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  40.71 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  40 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  41.84 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  40.14 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  38.51 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  41.26 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  38.62 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  44.29 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  40.14 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.57 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  38.69 
 
 
176 aa  87.8  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  38.57 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  37.96 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  41.01 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.57 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  37.59 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  32.37 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.26 
 
 
158 aa  76.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  34.06 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  37.06 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.93 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  33.57 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  32.68 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.43 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.86 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  35 
 
 
287 aa  72  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.86 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
274 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  35.97 
 
 
295 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  33.57 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.21 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.42 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  34.48 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.86 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  35.51 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.56 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  32.88 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.56 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  33.57 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.91 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  36.42 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  33.78 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.87 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.19 
 
 
300 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  29.37 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  33.09 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  32.86 
 
 
217 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  34.29 
 
 
294 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.19 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.37 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.25 
 
 
280 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
449 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.67 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  29.17 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  29.17 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  33.33 
 
 
159 aa  62.8  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  30.28 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  33.78 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.87 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  32.19 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.57 
 
 
288 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.72 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.77 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  32.43 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30.14 
 
 
142 aa  60.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  30.82 
 
 
277 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  30.82 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  29.37 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  28.77 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  29.58 
 
 
288 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  34.64 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  29.37 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  31.82 
 
 
305 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.64 
 
 
304 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.17 
 
 
144 aa  59.3  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>