More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3480 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  100 
 
 		 155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  51.68 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1686  UspA domain protein  38.16 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00978672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  35.81 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  35.76 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  28 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  34 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.56 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.76 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  32.03 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.97 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  36 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  34.69 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  37.67 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  30.61 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  30.52 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  30.52 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  36.3 
 
 		 294 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  31.51 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  36 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  35.62 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  30.82 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  36.05 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  41.22 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  41.22 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  38.22 
 
 		 292 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  40.54 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.65 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  30.56 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  35.57 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  30.52 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.82 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  34.23 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  30.32 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.43 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.97 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  31.03 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  32.43 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.65 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  32.21 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  29.05 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32.03 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.25 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.79 
 
 		 317 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.81 
 
 		 292 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 		 292 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  32.17 
 
 		 295 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  33.1 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 		 292 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  27.7 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  27.7 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  27.7 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  27.7 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.76 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  27.7 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2622  universal stress protein  29.93 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  27.7 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.03 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  34.46 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  30.13 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  29.05 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  29.73 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.03 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.46 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  30.14 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  34.23 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  31.85 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  32.43 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  32.89 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  27.92 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  32.45 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  28.95 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  30.56 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  35.17 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35.29 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  30.82 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  29.86 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>