More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5241 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  100 
 
 
154 aa  325  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  49.37 
 
 
180 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  46.84 
 
 
175 aa  144  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  46.58 
 
 
164 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  46.58 
 
 
164 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  44.3 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  45.91 
 
 
175 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  42.77 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  41.77 
 
 
182 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  41.77 
 
 
182 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  37.58 
 
 
177 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  39.62 
 
 
157 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  38.06 
 
 
157 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  39.62 
 
 
157 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  36.48 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1302  hypothetical protein  38.22 
 
 
158 aa  91.3  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  34.21 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.1 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  33.55 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30.26 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  33.99 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.47 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  31.41 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  29.87 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  30.52 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  35.76 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.63 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  33.77 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  28.86 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  29.8 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.29 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  32.26 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.06 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.1 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  28.67 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  28.77 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.54 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.06 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.32 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  30.38 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.34 
 
 
307 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  30.46 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  27.56 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  26.06 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
291 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  28.57 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  29.49 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  31.17 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  29.22 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  29.11 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  29.22 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  29.11 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  29.11 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  30.92 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  29.11 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  28.93 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  29.11 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  29.11 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  29.11 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  32.9 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  29.11 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  29.11 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.81 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  26.97 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
166 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
166 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  26.8 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  28.3 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
295 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  27.81 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  33.97 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  29.61 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  31.54 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  34 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  30 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>