More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1302 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1302  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  38.75 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  38.75 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  39.1 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  39.1 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  35.62 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  38.22 
 
 		 154 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  32.92 
 
 		 177 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  35.19 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 175 aa  90.9  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  37.43 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  37.43 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  35.22 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  33.73 
 
 		 173 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  34.36 
 
 		 180 aa  84.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  34.59 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  30.06 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  30.06 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  30.06 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  30.06 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  30.06 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  30.06 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  30.06 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  30.06 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  30.06 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  29.38 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  30.57 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  29.38 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  33.12 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  31.21 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  32.03 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  31.87 
 
 		 314 aa  64.3  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  32.08 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.17 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  28.39 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  28.48 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  29.03 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.63 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  29.03 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  26.62 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  26.62 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.39 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  28.03 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.93 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  32.03 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  29.22 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  27.5 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  27.95 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  27.56 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.03 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.93 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  28.85 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  25.62 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  25.62 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  28.85 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  29.75 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  29.75 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  31.14 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  27.74 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  32.05 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0180  UspA domain protein  29.68 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.242763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  40.22 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  32.05 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  29.38 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.27 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.33 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.97 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  26.75 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  28.83 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.76 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  28.97 
 
 		 301 aa  57.4  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  30.13 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  30.13 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  28.93 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  29.87 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  27.45 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.39 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.16 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  30.77 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  29.87 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  25 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  27.56 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>