More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6657 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  100 
 
 
311 aa  608  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  43.73 
 
 
305 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  37.66 
 
 
309 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  41.31 
 
 
303 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.71 
 
 
314 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.01 
 
 
320 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  33.45 
 
 
287 aa  106  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.8 
 
 
290 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.69 
 
 
304 aa  99.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  31.31 
 
 
297 aa  99.4  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.83 
 
 
288 aa  97.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  28.8 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
317 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.8 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  34.27 
 
 
415 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  31.06 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  29.7 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  29.97 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  31 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  34.03 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  31.47 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  31.23 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  40.25 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  31.47 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  27.9 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.96 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  32.68 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  26.77 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  29.55 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  27.65 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  28.01 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
145 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  22.7 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  27.44 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  28.71 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.61 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  29.91 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  24.52 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.25 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.57 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.46 
 
 
170 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.46 
 
 
170 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.45 
 
 
449 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  42.18 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.05 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  29.27 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  38.82 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  28.25 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.73 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  42.18 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  30.07 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  30.17 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
145 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  30.51 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
145 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  24.26 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  28.08 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  38.16 
 
 
162 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  28.16 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  31.86 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  28.16 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  30.46 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  31.35 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  29.74 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  33.66 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.17 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  33.78 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  33.78 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  28.57 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.54 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  31.16 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.73 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  34.72 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.75 
 
 
159 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 
145 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.61 
 
 
152 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.26 
 
 
154 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
142 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36.31 
 
 
152 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  29.01 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  40.41 
 
 
164 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  29.01 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  35.57 
 
 
148 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  27.27 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
151 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.94 
 
 
152 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 
148 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  28.67 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>