More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2770 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  100 
 
 
298 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  54.39 
 
 
298 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  45.73 
 
 
294 aa  242  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  42.47 
 
 
309 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  42.47 
 
 
291 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  42.12 
 
 
291 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  37.97 
 
 
297 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  38.57 
 
 
291 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  35.37 
 
 
294 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  32.76 
 
 
301 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 
306 aa  122  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  31.38 
 
 
289 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  31.31 
 
 
295 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  26.32 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
293 aa  109  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 
323 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  30.38 
 
 
293 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  31.98 
 
 
297 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  32.2 
 
 
301 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  30.95 
 
 
352 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  30.18 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  32.32 
 
 
286 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  34.24 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  26.46 
 
 
297 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  32.99 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
300 aa  90.9  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  31.99 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.49 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.04 
 
 
320 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  31.66 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  31.85 
 
 
309 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  27.46 
 
 
297 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  30.84 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  30.17 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  30.58 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.92 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  30 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  28.04 
 
 
285 aa  79  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  30.33 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.83 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  29.24 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  26.51 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  28.3 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  32.64 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  29.28 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  32.13 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  28.94 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  28.76 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  25 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.37 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  28.72 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  32.11 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  32.27 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.78 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  24.1 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  31.86 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  27.36 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  30.11 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  28.12 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  27.73 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.98 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  28.72 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.62 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  37.25 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  28.38 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  24.09 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  34.87 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  34.03 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  34.03 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  26.69 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.52 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66460  hypothetical protein  28.57 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3607  hypothetical protein  33.1 
 
 
166 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  33.18 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  26.86 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  30.74 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.17 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5764  hypothetical protein  27.31 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  27.7 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  27.85 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  20.09 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1767  hypothetical protein  25.97 
 
 
282 aa  63.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  27 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  33.54 
 
 
170 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  33.54 
 
 
170 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
153 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.1 
 
 
147 aa  62.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.21 
 
 
149 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  29.78 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  29.57 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  30.45 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>