More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2887 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  100 
 
 
325 aa  649    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  46.01 
 
 
291 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.23 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  33.13 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.48 
 
 
307 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.3 
 
 
320 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  31.02 
 
 
415 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.58 
 
 
288 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  34.49 
 
 
291 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  29.23 
 
 
449 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  33.87 
 
 
297 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  32.3 
 
 
297 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  33.12 
 
 
306 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  31.17 
 
 
281 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  31.75 
 
 
304 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  31.83 
 
 
305 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  29.47 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  25.79 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.26 
 
 
280 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  29.35 
 
 
297 aa  95.9  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  26.69 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  33.21 
 
 
317 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.76 
 
 
159 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  29.55 
 
 
283 aa  92.8  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 
153 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  38.82 
 
 
156 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  41.03 
 
 
148 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  40.13 
 
 
200 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 
156 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  29.1 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  29.03 
 
 
286 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  38.26 
 
 
154 aa  89.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  29.54 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  31.73 
 
 
287 aa  89  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  29.34 
 
 
300 aa  89.4  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  32.2 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.42 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  38.82 
 
 
152 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  31.39 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  28.8 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.06 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  30.52 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 
157 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
142 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  38.41 
 
 
152 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
157 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  36.24 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  40.79 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  40.79 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  40.79 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  40.79 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  40.79 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  40.79 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  39.61 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.82 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  24.53 
 
 
288 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  28.03 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 
164 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  33.48 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  26.2 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  35.8 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  29.25 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  37.13 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  34.64 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  31.82 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.3 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  25.89 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  30.24 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  31.46 
 
 
318 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  36.49 
 
 
141 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
159 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 
155 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  29.88 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  28.96 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 
143 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  37.16 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  35.1 
 
 
145 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  33.33 
 
 
152 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  36.65 
 
 
156 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  27.44 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  35.27 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  34.42 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  32.67 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  32.67 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  32.67 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  32.67 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  32.67 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  31.09 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  30.65 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  32.67 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  32.67 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  32.67 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  35.76 
 
 
151 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>