More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4818 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  100 
 
 		 321 aa  636    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  28.8 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  27.85 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  27.53 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  35.51 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  28.62 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  28.88 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  33.02 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  31.93 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  31.08 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  31.9 
 
 		 297 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  30.25 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  29.52 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.91 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  29.46 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  26.38 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  25.77 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  33.33 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  27.73 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 145 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  27.8 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  31.01 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  25.12 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  32.9 
 
 		 148 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  28.61 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  28.71 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.33 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  34.62 
 
 		 144 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  26.42 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  25.77 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.36 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  31.21 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.53 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  26.1 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.35 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  23.2 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  33.93 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  26.65 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.14 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  26.56 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  21.47 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  25.77 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.1 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  27.22 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.75 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  33.33 
 
 		 140 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  24.68 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  26.53 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  26.04 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.52 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30.86 
 
 		 154 aa  57  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  25.64 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  25.88 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  27.01 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  26.45 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  22.46 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  27.33 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  29.03 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  26.25 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.49 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  26.25 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  29.31 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  26.92 
 
 		 145 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  28.21 
 
 		 140 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 150 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.3 
 
 		 150 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.3 
 
 		 128 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  30.63 
 
 		 173 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.93 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  25.76 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 145 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  26.72 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  28.72 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  25.64 
 
 		 145 aa  54.3  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  28.72 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  24.38 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  28.72 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.21 
 
 		 152 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 		 148 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  26.92 
 
 		 153 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.06 
 
 		 142 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  29.63 
 
 		 187 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  26.28 
 
 		 144 aa  52.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.44 
 
 		 149 aa  52.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  23.58 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  24.48 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 140 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  37.65 
 
 		 141 aa  52.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.48 
 
 		 153 aa  52.8  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 145 aa  52.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1011  UspA domain protein  24.72 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000787918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  27.44 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  38.24 
 
 		 155 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>