67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1011 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1011  UspA domain protein  100 
 
 
292 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000787918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2244  UspA domain protein  59.59 
 
 
292 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.616395 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2182  UspA domain protein  59.59 
 
 
292 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0255  UspA domain protein  40.07 
 
 
291 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955091  normal  0.331109 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  24.75 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  24.74 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  23.02 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  24.54 
 
 
281 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  25.89 
 
 
293 aa  59.3  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  23.79 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  21.94 
 
 
157 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  24.44 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  28.15 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  24.89 
 
 
295 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  21.3 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  19.11 
 
 
294 aa  52.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.56 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  24.72 
 
 
321 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  24.29 
 
 
140 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  24.29 
 
 
140 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  25.17 
 
 
149 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  24.29 
 
 
140 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  23.93 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  24.34 
 
 
157 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  25 
 
 
140 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  24.29 
 
 
140 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  37.5 
 
 
140 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  24.29 
 
 
140 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  24.29 
 
 
140 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  19.73 
 
 
296 aa  49.7  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 
138 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  24.29 
 
 
140 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  40.62 
 
 
140 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  24.29 
 
 
140 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  30.99 
 
 
138 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 
138 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  21.07 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  23.79 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  22.22 
 
 
147 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.14 
 
 
274 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  25 
 
 
151 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  23.08 
 
 
150 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  21.74 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  25 
 
 
141 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  28.24 
 
 
622 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  20.46 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  22.15 
 
 
156 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  27.34 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  26.76 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  22.67 
 
 
154 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  23.84 
 
 
152 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  31.52 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  27.45 
 
 
151 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  27.45 
 
 
151 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  22.6 
 
 
147 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  21.95 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1767  hypothetical protein  18.88 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  32 
 
 
145 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  25.49 
 
 
151 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.28 
 
 
157 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  28.91 
 
 
136 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  23.24 
 
 
145 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  21.43 
 
 
137 aa  42.7  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  24.32 
 
 
317 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  30.65 
 
 
284 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  28.79 
 
 
141 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  24.26 
 
 
140 aa  42.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>