More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2546 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  100 
 
 
390 aa  758    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  47.47 
 
 
306 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  44.95 
 
 
325 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  39.86 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  36.16 
 
 
297 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  35.2 
 
 
317 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  36.29 
 
 
345 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
291 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 
449 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  34.88 
 
 
297 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 
324 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  30.52 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  28.22 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  29.27 
 
 
287 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  27.87 
 
 
287 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.69 
 
 
291 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  31.97 
 
 
301 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  33.55 
 
 
307 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
325 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.37 
 
 
288 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  31.08 
 
 
321 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  41.26 
 
 
145 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.3 
 
 
320 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  40.56 
 
 
145 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  31.99 
 
 
281 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.15 
 
 
290 aa  94.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  31.33 
 
 
303 aa  92.8  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  31.54 
 
 
286 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  38.81 
 
 
145 aa  90.9  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  29.56 
 
 
300 aa  90.1  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 
314 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  32.03 
 
 
415 aa  89.7  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  37.31 
 
 
145 aa  87.4  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
145 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.71 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  30.89 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  28.62 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  35.86 
 
 
151 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  33.6 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  28.43 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  29.07 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  35.42 
 
 
212 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  39.04 
 
 
144 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  39.04 
 
 
187 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  30.59 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  31.55 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  31.17 
 
 
301 aa  77  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  37.01 
 
 
200 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  41.01 
 
 
158 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  35.21 
 
 
150 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  28.53 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  30.1 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.86 
 
 
153 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
156 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
156 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  37.32 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  36.99 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  28.53 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  28.53 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  39.04 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  32.14 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  33.8 
 
 
207 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32.14 
 
 
152 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  40.56 
 
 
158 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  39.73 
 
 
152 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.41 
 
 
152 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  39.73 
 
 
155 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  31.48 
 
 
297 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
155 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  37.18 
 
 
173 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  34.23 
 
 
146 aa  70.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36.49 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.23 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  30.5 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  35.21 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  39.13 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  36.24 
 
 
165 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  33.99 
 
 
151 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  33.99 
 
 
151 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  38.1 
 
 
159 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  38 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.06 
 
 
180 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  22.33 
 
 
276 aa  68.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  42.31 
 
 
108 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  36.3 
 
 
147 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.28 
 
 
150 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  35.25 
 
 
140 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  34.69 
 
 
151 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  36.73 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
153 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  38.36 
 
 
157 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
153 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>