More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0641 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 314 aa  614  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  36.58 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  34.45 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  34.43 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  29.01 
 
 		 449 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.92 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  31.13 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  30.98 
 
 		 317 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  26.09 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.32 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.03 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.15 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  38.22 
 
 		 173 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  24 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  31.05 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  36.6 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.13 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  23.67 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  37.41 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  27.91 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  36.6 
 
 		 169 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.84 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  36.73 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  38.51 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  24.24 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  34.93 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.2 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  34.93 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  34.93 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  34.93 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  34.93 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  34.93 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  34.18 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  38.1 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  25.91 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  24.2 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  34.25 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.55 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.57 
 
 		 415 aa  72.4  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  25 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.1 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  25.25 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  26.16 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.21 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.33 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  28.86 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  27.6 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 146 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  25 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  28.2 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 155 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  35.29 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  26.32 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  26.23 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  28.38 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 163 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  32.67 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  32.67 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.49 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.56 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  32.67 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 163 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.21 
 
 		 145 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  33.78 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  22.52 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  31.58 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  27.42 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 167 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  27.33 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  28.69 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  30.82 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  27.27 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  32.19 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  30.61 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  33.79 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  30.57 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  31.94 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.95 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.79 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>