More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0914 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 297 aa  587  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  78.79 
 
 		 297 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  34.54 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  37.37 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.67 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  33.68 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  32.7 
 
 		 449 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  33.67 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  34.88 
 
 		 390 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.76 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.67 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  27.99 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.44 
 
 		 307 aa  116  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  26.28 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  32.72 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  32.25 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  33.67 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  33.02 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  31.35 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  29.93 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  31.63 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  30.52 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  29.83 
 
 		 281 aa  99.4  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  29.63 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.98 
 
 		 415 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  28.9 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  32.7 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  29.33 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.04 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  29.69 
 
 		 345 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.13 
 
 		 180 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  26.35 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  24.5 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  27.3 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  29.62 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35 
 
 		 150 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.85 
 
 		 158 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  30.69 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  27.27 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  27.91 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  25.25 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.14 
 
 		 145 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  33.56 
 
 		 151 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  21.52 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.66 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 145 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  32.39 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  35.21 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.81 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.46 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.46 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  26.75 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.57 
 
 		 142 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  28.23 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 164 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  26.51 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.61 
 
 		 147 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  18.86 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.98 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  37.18 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  35.1 
 
 		 151 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  32.19 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  27.36 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  36.43 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.62 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.46 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.04 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.57 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  26.06 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.77 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  25.41 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  32.37 
 
 		 148 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  22.3 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  37.04 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  30.56 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  25.82 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  33.78 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  30.33 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.21 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 		 750 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  26.6 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  19.47 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  29.57 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  26.33 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  31.25 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  26.97 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 145 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  33.12 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  27.69 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 		 155 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>