More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0254 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  100 
 
 		 288 aa  593  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  74.91 
 
 		 289 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  55.23 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  47.12 
 
 		 277 aa  262  6e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  38.91 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  34.78 
 
 		 276 aa  178  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  30.74 
 
 		 282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  30.39 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  28.07 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  29.71 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.43 
 
 		 320 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.28 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.21 
 
 		 288 aa  95.9  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  28.27 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.11 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.29 
 
 		 304 aa  92.4  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  27.63 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  26.87 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 145 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  35.62 
 
 		 149 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  38.13 
 
 		 159 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  27.37 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  36.24 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.43 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.9 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.9 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  24.08 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  34.25 
 
 		 149 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.57 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  34.72 
 
 		 155 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  25.83 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  27.69 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  25.59 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  32.68 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  24.83 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  24.03 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.05 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  37.14 
 
 		 158 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  35.33 
 
 		 145 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 164 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.33 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.57 
 
 		 162 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.27 
 
 		 153 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  22.95 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  34.75 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  34.75 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  35.37 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  36.55 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  29.95 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.49 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  28.21 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  32.45 
 
 		 152 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  26 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.76 
 
 		 154 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.82 
 
 		 159 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35.46 
 
 		 151 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  24.47 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 147 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  24.16 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  32.89 
 
 		 144 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  25.25 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 151 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  23.47 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.25 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.01 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  33.57 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  25.18 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.76 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.41 
 
 		 149 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.69 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  24.57 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  34.27 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  30.82 
 
 		 162 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1652  UspA domain protein  26.14 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.432641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.79 
 
 		 147 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.64 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  34 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.48 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  26.5 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.51 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  27.17 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  32.43 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  27.09 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.94 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  27.54 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  34.72 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  32.89 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.53 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>