More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_580 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  100 
 
 		 287 aa  585  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  89.9 
 
 		 287 aa  535  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  87.8 
 
 		 287 aa  523  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  88.99 
 
 		 296 aa  422  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  29.37 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 449 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  27.85 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  28.43 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  26.42 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  28.22 
 
 		 390 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  26.4 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.08 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.3 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  25.89 
 
 		 324 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.8 
 
 		 304 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  28.19 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  25.5 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  29.34 
 
 		 317 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  29.53 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  26.09 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  25.89 
 
 		 305 aa  89  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  24.08 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  23.97 
 
 		 325 aa  86.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  22.34 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  25.86 
 
 		 281 aa  86.3  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  26.74 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.74 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  23.33 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  31.98 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  25.95 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  21.85 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  24.37 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  25.25 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  25.34 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  31.58 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  23.9 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  24.42 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  23.61 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  27.62 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  21.72 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  27.62 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  27.62 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.09 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  27.62 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.61 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  30.65 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  22.74 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  27.66 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  27.5 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 151 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 156 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 148 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  30.26 
 
 		 157 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  32.28 
 
 		 147 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  26.03 
 
 		 152 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  22.82 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  27.4 
 
 		 157 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  26.07 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.84 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  27.4 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  27.92 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  27.62 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  28.68 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  25.25 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  23.66 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  28.79 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  25.83 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  27.86 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  31.13 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  26.21 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  28.37 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  27.55 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  24.52 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  28.97 
 
 		 155 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  31.9 
 
 		 169 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  21.19 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  28.97 
 
 		 155 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  29.33 
 
 		 144 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  26.96 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  23.4 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  26 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  29.85 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 		 128 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  24.83 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>