More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1525 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  99.37 
 
 
319 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  100 
 
 
315 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  99.68 
 
 
315 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  89.52 
 
 
315 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  51.27 
 
 
316 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  51.89 
 
 
313 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  48.99 
 
 
317 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  49.5 
 
 
317 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5604  UspA domain protein  47.3 
 
 
317 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.945797  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  47.18 
 
 
318 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3786  UspA domain-containing protein  43.37 
 
 
311 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  42.9 
 
 
319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4253  UspA domain-containing protein  43.62 
 
 
314 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162019  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4249  UspA domain-containing protein  42.28 
 
 
312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5983  UspA domain-containing protein  42.28 
 
 
311 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.965919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3995  hypothetical protein  41.61 
 
 
311 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4372  UspA domain-containing protein  41.61 
 
 
311 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520277  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1645  universal stress protein  41.45 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206293  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  37.25 
 
 
156 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  41.06 
 
 
152 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  35.05 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
153 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  38.46 
 
 
168 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  37.33 
 
 
156 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  38 
 
 
200 aa  86.3  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  39.19 
 
 
151 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  33.56 
 
 
151 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  33.56 
 
 
151 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  27.99 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.55 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.68 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
159 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
159 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  32.19 
 
 
157 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 
167 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  36.73 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.22 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  31.94 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  34.69 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  37.24 
 
 
157 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 
156 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.32 
 
 
159 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  36.55 
 
 
155 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  36 
 
 
156 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  28.91 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  31.44 
 
 
305 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  29.33 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  30.65 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  34.51 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  34.27 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  34.93 
 
 
151 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  34.93 
 
 
151 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.41 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  36.3 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.09 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 
163 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  33.1 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  33.1 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  28.53 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  34.75 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.51 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  38 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  38 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  38 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  38 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  38 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  35.57 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  31.19 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
162 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.11 
 
 
155 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  27.62 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  38 
 
 
200 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
155 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  27.92 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.41 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  34.9 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  35.37 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  30.57 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.86 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  37.06 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1184  hypothetical protein  50.6 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  35.51 
 
 
136 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  22.48 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  35.86 
 
 
155 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  56.86 
 
 
173 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.72 
 
 
158 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3738  UspA domain protein  33.88 
 
 
155 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
163 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  30.5 
 
 
165 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  29.17 
 
 
151 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4815  UspA domain protein  33.88 
 
 
155 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  36.55 
 
 
158 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>