More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1274 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  100 
 
 
145 aa  293  5e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36.81 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  36.43 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  34.97 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  34.72 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.41 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.97 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  31.47 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  32.17 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.97 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.21 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  30.77 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.79 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
150 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  33.56 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  31.47 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  35.57 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.89 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  33.1 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.29 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.94 
 
 
320 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  34.48 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  31.72 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  31.91 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  32.19 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  35 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.97 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.03 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  29.66 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  30.07 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  30.07 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  30.07 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  30.07 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  30.07 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  30.07 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  30.07 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.72 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.04 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.37 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  36.62 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  36.67 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.46 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  31.54 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.66 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.19 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  35.66 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  30.77 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  30.61 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  29.58 
 
 
325 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  33.1 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.78 
 
 
290 aa  71.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.56 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  30.07 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  31.72 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  29.37 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  35 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
172 aa  70.1  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  31.91 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  31.51 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.51 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  29.93 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  29.73 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.43 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  31.51 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  29.5 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  30.07 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  30.07 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  34.46 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  28.97 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>