More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4244 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  100 
 
 
283 aa  548  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  49.64 
 
 
280 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  44.77 
 
 
305 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  44.37 
 
 
288 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  43.01 
 
 
297 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  40.07 
 
 
281 aa  159  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  39.86 
 
 
290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  40 
 
 
304 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  39.25 
 
 
307 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  35.74 
 
 
300 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  35.76 
 
 
287 aa  142  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  35.25 
 
 
286 aa  142  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  34.69 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  36.05 
 
 
320 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  33.44 
 
 
301 aa  115  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 
297 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  33.9 
 
 
415 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  47.1 
 
 
144 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  45 
 
 
152 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  31.63 
 
 
297 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  41.78 
 
 
152 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  42.86 
 
 
208 aa  99  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  32.44 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  32.41 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  41.43 
 
 
180 aa  96.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  46.53 
 
 
158 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  32.41 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.27 
 
 
150 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  31.72 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  33.33 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  42.67 
 
 
156 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  41.5 
 
 
153 aa  92.8  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  41.29 
 
 
155 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
323 aa  92.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
145 aa  92  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  42.45 
 
 
159 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  40.58 
 
 
136 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  38.93 
 
 
173 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  34.04 
 
 
147 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  28.71 
 
 
305 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  41.18 
 
 
156 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  32.53 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  40.56 
 
 
149 aa  89.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  32.34 
 
 
291 aa  89  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
148 aa  87.8  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  38.3 
 
 
145 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
145 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  37.68 
 
 
207 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
145 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  26.44 
 
 
276 aa  87  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  36.73 
 
 
159 aa  86.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  38.46 
 
 
150 aa  86.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  31.05 
 
 
314 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  40.58 
 
 
144 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  41.73 
 
 
138 aa  85.9  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  29.21 
 
 
325 aa  85.5  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  36.59 
 
 
169 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.97 
 
 
147 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  23.71 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  29.47 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  25.95 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  42 
 
 
156 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 
143 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  24.08 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  38 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  45.07 
 
 
140 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  30.59 
 
 
390 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
151 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  42.34 
 
 
138 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  42.36 
 
 
148 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
145 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  33.8 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.66 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  30.29 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  26.04 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  28.38 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  37.04 
 
 
145 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.87 
 
 
150 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  35.81 
 
 
150 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  38.82 
 
 
157 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  42.25 
 
 
143 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.62 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  40.69 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  27.27 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  37.86 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  31.58 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  38.3 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  38.3 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  38.62 
 
 
187 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  25.68 
 
 
287 aa  79  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  30.35 
 
 
303 aa  79  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  25.36 
 
 
750 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  35.42 
 
 
152 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  41.26 
 
 
148 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  29.05 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  29.15 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  27.45 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>