More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3462 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
750 aa  1486    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  35.88 
 
 
748 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  37.14 
 
 
749 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  44.39 
 
 
460 aa  323  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  48.49 
 
 
435 aa  312  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  45.03 
 
 
446 aa  302  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  43.16 
 
 
436 aa  284  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  42.49 
 
 
452 aa  268  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  43.83 
 
 
573 aa  263  8e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  33.27 
 
 
747 aa  231  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 
756 aa  221  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  36.04 
 
 
495 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 
723 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
715 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
715 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  33.09 
 
 
767 aa  203  8e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  27.57 
 
 
764 aa  198  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 
715 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  31.57 
 
 
448 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  31.57 
 
 
448 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  33.01 
 
 
421 aa  193  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  32.04 
 
 
775 aa  187  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  34.27 
 
 
689 aa  183  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  34.84 
 
 
420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  32.94 
 
 
419 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 
423 aa  180  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 
445 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  36.54 
 
 
416 aa  175  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  34.02 
 
 
460 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  32.04 
 
 
703 aa  174  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 
482 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.84 
 
 
430 aa  172  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  32 
 
 
455 aa  172  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  31.13 
 
 
816 aa  169  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 
414 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 
422 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  33.73 
 
 
406 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  33.73 
 
 
406 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  34.37 
 
 
683 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  30.84 
 
 
474 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  29.28 
 
 
951 aa  158  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 
412 aa  157  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 
414 aa  157  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  32.67 
 
 
385 aa  156  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  30.32 
 
 
414 aa  154  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  31.15 
 
 
398 aa  153  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 
382 aa  153  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  31.69 
 
 
883 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.59 
 
 
427 aa  152  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 
396 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.17 
 
 
442 aa  151  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  31.31 
 
 
491 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  31.8 
 
 
424 aa  150  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 
424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 
425 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 
467 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 
467 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 
410 aa  146  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  31.78 
 
 
429 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  28.97 
 
 
387 aa  144  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.39 
 
 
410 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  28.72 
 
 
387 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  29.25 
 
 
375 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  28.46 
 
 
387 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  30.39 
 
 
410 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  32.56 
 
 
767 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  28.93 
 
 
389 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  28.46 
 
 
387 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  28.46 
 
 
387 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.39 
 
 
410 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  28.46 
 
 
387 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  31.03 
 
 
469 aa  140  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  28.46 
 
 
387 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  28.46 
 
 
387 aa  140  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  28.2 
 
 
375 aa  139  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  28.46 
 
 
387 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  28.46 
 
 
387 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  27.46 
 
 
385 aa  139  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 
425 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  30.9 
 
 
427 aa  137  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 
473 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 
413 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 
435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  28.75 
 
 
375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  28.07 
 
 
375 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  28.93 
 
 
389 aa  134  6.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  30.47 
 
 
453 aa  133  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 
400 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  27.82 
 
 
375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  27.82 
 
 
375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.82 
 
 
375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  27.82 
 
 
375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  27.82 
 
 
375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.68 
 
 
386 aa  130  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.32 
 
 
399 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.74 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 
425 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 
414 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  28.26 
 
 
414 aa  127  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  29.6 
 
 
404 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>