275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0871 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  100 
 
 		 304 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  61.06 
 
 		 303 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  61.06 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  56.52 
 
 		 307 aa  362  6e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  55.41 
 
 		 308 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  53.85 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  39.8 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  36.21 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.62 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.38 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  31.02 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.38 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  25.28 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  30.34 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  26.71 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.54 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.65 
 
 		 149 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  26.3 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.01 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.7 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.97 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  29.66 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.85 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  27.54 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  27.48 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.25 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.42 
 
 		 138 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  29.45 
 
 		 148 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 162 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.47 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  33.12 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.67 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  23.66 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  27.36 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 160 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  31.25 
 
 		 149 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  26.78 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  27.62 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  25.37 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  31.01 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  29.79 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  23.96 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  27.86 
 
 		 159 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.21 
 
 		 153 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.21 
 
 		 153 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  26.76 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32.21 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  24.15 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  26.11 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  33.74 
 
 		 149 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  26.44 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  30.85 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2623  putative universal stress protein  25.72 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  31.21 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  27.63 
 
 		 153 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  29.41 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  27.63 
 
 		 155 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 151 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  27.78 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 156 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  25.37 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  22.64 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  26.99 
 
 		 515 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  23.17 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 151 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  25.17 
 
 		 161 aa  53.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  28.08 
 
 		 273 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  28.77 
 
 		 166 aa  53.1  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  24.35 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 153 aa  53.1  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  26.23 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  30.57 
 
 		 153 aa  52.8  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 		 142 aa  52.8  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  35.22 
 
 		 138 aa  52.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  31.45 
 
 		 151 aa  52.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.19 
 
 		 143 aa  52.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  31.45 
 
 		 151 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  28.57 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  28.39 
 
 		 159 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 144 aa  52.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  26.04 
 
 		 282 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 177 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  27.78 
 
 		 145 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  28.1 
 
 		 146 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  27.95 
 
 		 144 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  24.53 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  29.8 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  23.97 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 		 147 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  26.89 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.39 
 
 		 156 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>