More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2552 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  100 
 
 		 305 aa  635    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  72.46 
 
 		 308 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  71.34 
 
 		 307 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  52.12 
 
 		 308 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  53.85 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  50.98 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  38.8 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  33.11 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.29 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.71 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.94 
 
 		 320 aa  89  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 147 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  37.32 
 
 		 149 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  37.32 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  33.8 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  24.81 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.1 
 
 		 147 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  25.83 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  29.37 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 160 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.57 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.62 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  25.24 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  28.72 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  35.21 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.33 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  24.24 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  28.57 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  26.98 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.8 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  25.41 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  27.3 
 
 		 415 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  24.53 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  28.39 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  28.87 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  25.99 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 151 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  26.16 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  26.69 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  28.97 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 151 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  24.6 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 145 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  26.5 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.29 
 
 		 159 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  24.58 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  22.37 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  29.56 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  22.58 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 449 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 138 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  24.91 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  28.66 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  25.32 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  23.38 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  29.93 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.65 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.77 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  23.95 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  25.4 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  24.76 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  24.83 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  22.39 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  30.99 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  26.83 
 
 		 150 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 143 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  23.45 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  24.42 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  25.33 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  23.73 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  30.38 
 
 		 151 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.45 
 
 		 162 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  23.19 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  28.57 
 
 		 161 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  23.86 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.13 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  21.05 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.13 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  26.56 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  27.5 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  25.75 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  25.97 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  29.03 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.46 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.46 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  31.37 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>