More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1314 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 323 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  39.66 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  34.36 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  32.32 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  32.08 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  33.56 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  32.03 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  28.33 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  32.65 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  32.31 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  30.84 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  31.53 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  28.42 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  31.76 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  31.38 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  30.9 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  35.25 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  30.74 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  28.14 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  31.06 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.48 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  31.63 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.07 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  31.79 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.4 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  33.8 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  27.71 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  27.76 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  25.16 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  28.97 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  27.15 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  27.21 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  25.82 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  25.17 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  27.8 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  25.73 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  30.29 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  28.28 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  30.6 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  28.25 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  24.68 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  27.94 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  28.17 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5764  hypothetical protein  28.04 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  28 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.67 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  23.05 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  31.28 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  25.81 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  26.05 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  27.12 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.38 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  26.06 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  28.52 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  26.06 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  24.35 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  26.06 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66460  hypothetical protein  29.15 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  26.06 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  29.43 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  25.32 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  25.32 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  25.32 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02064  universal stress protein UspE  25.57 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00593148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  25.73 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  25.24 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  25.32 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.86 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  27.78 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  24.36 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  29.17 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  24.67 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30 
 
 		 154 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  25 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 155 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  31.88 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  21.86 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  34.23 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0609  UspA domain protein  25 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  26.69 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  35.81 
 
 		 155 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  25.64 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  34 
 
 		 156 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  30.07 
 
 		 161 aa  67  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.79 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.82 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.1 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5983  UspA domain-containing protein  27.24 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965919 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  24.88 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  32.08 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>