More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1414 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  31.86 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  33.66 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  33.44 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  33.44 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  33.54 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25.41 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  30.77 
 
 		 309 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  27.95 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  30.59 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  33.22 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  32.68 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  30.58 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  31.96 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  30.2 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  32.8 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  31.13 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  36.56 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.33 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.34 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  25.93 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  33.22 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  29.47 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  30.74 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  29.72 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  33.69 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  30.13 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  22.69 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  30.4 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  32.27 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  28.16 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  19.87 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.51 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  30.97 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  28.12 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  28.53 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  31.44 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.78 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  32.87 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.59 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  31.84 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  27.24 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  22.73 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.53 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.76 
 
 		 149 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  32.66 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  28.96 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  23.99 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  28.85 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  28.95 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  30.52 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  30.52 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  33.52 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  27.18 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  30.23 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  30.1 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  36.36 
 
 		 154 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  26.19 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  30.39 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 140 aa  64.3  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.12 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  33.18 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  33.18 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4249  UspA domain-containing protein  33.18 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.38 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  28.3 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  25.08 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  32.21 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  29.45 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  33.18 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  38.69 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  35.62 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  32.24 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  32.16 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  24.72 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  28.9 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  25 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  24.84 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.84 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  26.43 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.89 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  24.27 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  29.38 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  19.51 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 155 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  26.97 
 
 		 155 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  32.65 
 
 		 146 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  28.22 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5983  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965919 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  25.08 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  28.64 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4372  UspA domain-containing protein  31.19 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>