More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5551 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  100 
 
 		 165 aa  330  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  61.64 
 
 		 184 aa  177  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  51.35 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  48.65 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  48.65 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  48.65 
 
 		 200 aa  140  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  50 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  49.66 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  49.32 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  49.32 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  49.32 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  49.32 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  49.32 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  48 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  45.91 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  46.54 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  43.4 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  43.84 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  44.17 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  42.77 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  43.15 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  43.15 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  43.15 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  42.67 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  43.83 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  44.1 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  46.58 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  44 
 
 		 150 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  46.58 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  42.67 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  46.21 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  42.67 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  45.89 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  47.95 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  47.95 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  47.95 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  47.95 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  47.95 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  47.95 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  46.41 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  43.62 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  40.94 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  44.31 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  41.4 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  41.38 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  41.4 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  41.4 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  41.4 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  41.4 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  41.4 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  41.4 
 
 		 155 aa  98.2  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  42.38 
 
 		 151 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  42.38 
 
 		 151 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  42 
 
 		 155 aa  97.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  43.33 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  41.22 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  43.66 
 
 		 317 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  36.81 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  37.18 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 156 aa  91.3  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  38.78 
 
 		 187 aa  90.5  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  38.51 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  38.51 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  37.93 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  37.18 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 145 aa  84.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 169 aa  84  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  36.05 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  38.51 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  39.19 
 
 		 146 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  37.82 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  36.05 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.79 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  39.86 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  39.86 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  39.86 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  39.86 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  39.86 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  39.86 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  35.4 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 318 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  37.33 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  38 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  33.55 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  36.73 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.33 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>