More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5580 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  100 
 
 		 168 aa  337  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  66.67 
 
 		 168 aa  216  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  56.89 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  58.44 
 
 		 164 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  52.98 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  57.14 
 
 		 167 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  55.7 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  57.24 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  56.55 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  57.79 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  57.79 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  57.79 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  57.79 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  57.79 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  57.79 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  50.64 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  52.38 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  49.36 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  52.38 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  49.67 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  51.7 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  51.7 
 
 		 155 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  51.7 
 
 		 155 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  51.7 
 
 		 155 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  47.53 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  51.7 
 
 		 155 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  51.03 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  51.03 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  51.03 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  50.34 
 
 		 156 aa  143  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  50.34 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  49.32 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  49.32 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  45.52 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  48.97 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  44.83 
 
 		 151 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  44.14 
 
 		 151 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  44.14 
 
 		 151 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  43.71 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  44.17 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  39.07 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  42.94 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  44.3 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  41.33 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  42.48 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  42.41 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  38.62 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  44.97 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  43.54 
 
 		 166 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  38.41 
 
 		 200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  38.41 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  38.41 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  38.41 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  38.41 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  38.41 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  37.93 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  42.18 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  42.18 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  44.59 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  42.07 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  45.33 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  44 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  39.33 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  35.1 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  40.67 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  39.31 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  38.56 
 
 		 151 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  37.25 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  38.56 
 
 		 151 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  38.56 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  41.72 
 
 		 155 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  40.27 
 
 		 191 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  40.27 
 
 		 201 aa  90.9  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  40.27 
 
 		 201 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  39.04 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 148 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 318 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  39.04 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  39.04 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.84 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  38.16 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  38.36 
 
 		 146 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  39.86 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  37.91 
 
 		 155 aa  88.6  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  35.29 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  37.41 
 
 		 151 aa  88.2  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  39.04 
 
 		 152 aa  87.8  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 313 aa  87.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  35.86 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  39.33 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  35.71 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  39.19 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>