More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4395 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  100 
 
 		 164 aa  327  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  47.33 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  39.04 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  41.94 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  36.73 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  41.22 
 
 		 169 aa  97.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  40.65 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  39.04 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  39.74 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  39.74 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  36.94 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  35.62 
 
 		 156 aa  94.4  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  36.73 
 
 		 151 aa  94  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  36.73 
 
 		 151 aa  94  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  37.84 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  34.23 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  37.84 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  35.86 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  37.41 
 
 		 151 aa  92.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  35.86 
 
 		 155 aa  92.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  38.31 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  36.18 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  37.04 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  38.56 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  37.66 
 
 		 156 aa  91.3  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  91.3  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  40.65 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 156 aa  90.9  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  32.21 
 
 		 151 aa  90.5  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  32.21 
 
 		 151 aa  90.5  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  35.57 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  38.16 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  35.29 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  35.86 
 
 		 187 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 		 167 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  37.24 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  36.67 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  36.67 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  34.64 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  35.17 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  38.16 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  37.75 
 
 		 154 aa  87.4  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  36 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  31.72 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  31.72 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  31.72 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  37.84 
 
 		 158 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  31.72 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  31.72 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  31.72 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  37.42 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  33.11 
 
 		 155 aa  84  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.25 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  35.14 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.54 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  33.77 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  36.84 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  36.42 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  29.14 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  37.11 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  38.67 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  35.81 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  37.42 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  33.54 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.21 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.67 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.68 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  34.59 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  34.59 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  34.59 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  34.59 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  34.59 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  34.59 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  32.9 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  32.73 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  36.2 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  35.85 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  35.85 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  34.42 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  35.85 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>