More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0184 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  328  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  77.71 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  77.71 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  50.34 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  46.21 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  45.33 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  44 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  47.26 
 
 		 187 aa  120  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  44.59 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  41.5 
 
 		 151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  43.48 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  45.58 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  45.21 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  43.87 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  43.87 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  44.16 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  41.5 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  41.5 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  43.51 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  43.51 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  43.51 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  43.51 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  40.4 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  44.22 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  44.14 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  44.14 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  44.14 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  44.14 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  44.22 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  43.51 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  40.41 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  43.84 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  43.33 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  44.22 
 
 		 167 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  43.62 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  43.62 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  41.22 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  41.61 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  41.61 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  41.61 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  41.61 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  41.61 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  41.61 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  41.33 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  37.18 
 
 		 200 aa  97.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 163 aa  97.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  34.64 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  37.41 
 
 		 151 aa  95.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  40.69 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  35.62 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  39.73 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  36.3 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  37.09 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 157 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  34.93 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  41.72 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  41.98 
 
 		 169 aa  91.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  41.72 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  38.36 
 
 		 157 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  36.05 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  36.05 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  40.52 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  38.22 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 150 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  36.54 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  36.54 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  36.54 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  36.54 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  36.54 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  36.54 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  32.7 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  41.22 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  39.62 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  37.58 
 
 		 173 aa  87.8  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  38.99 
 
 		 156 aa  87.8  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  38.99 
 
 		 156 aa  87.8  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 147 aa  87.4  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  38.99 
 
 		 156 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  37.25 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  36.73 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  38.31 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  39.58 
 
 		 139 aa  84.7  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  38.56 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  37.18 
 
 		 162 aa  84  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  35.9 
 
 		 147 aa  84  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>