More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3776 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  98.73 
 
 		 157 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  89.74 
 
 		 156 aa  268  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  89.74 
 
 		 156 aa  268  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  89.74 
 
 		 156 aa  266  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  90.38 
 
 		 156 aa  257  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  85.23 
 
 		 169 aa  227  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  68.42 
 
 		 152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  67.76 
 
 		 191 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  67.76 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  67.76 
 
 		 152 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  67.76 
 
 		 152 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  67.76 
 
 		 152 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  67.11 
 
 		 201 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  49.32 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  53.74 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  49.32 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  49.32 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  41.22 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  41.22 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  41.22 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  41.77 
 
 		 200 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  38.71 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  42.28 
 
 		 156 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  39.88 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 150 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  41.61 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  38.99 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  38.69 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  43.4 
 
 		 164 aa  90.5  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  38.31 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  37.89 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  39.46 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  43.75 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  39.35 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  36 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  41.77 
 
 		 200 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  41.77 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  41.77 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  41.77 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  41.77 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  41.77 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  37.65 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  39.73 
 
 		 155 aa  87  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  37.58 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  41.83 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  41.83 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  38.71 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  38.71 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  42.38 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  39.02 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  42.18 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  38.71 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  39.46 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  38.31 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  36.48 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  36.71 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  37.58 
 
 		 155 aa  84  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  36.31 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  33.54 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  39.04 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  37.67 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  36.75 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  38.06 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  32.12 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  37.82 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  37.25 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  32.12 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  37.25 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  43.54 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  43.54 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  43.54 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  43.54 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  43.54 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  43.54 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  37.16 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  35.29 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  38 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  36.05 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  36.24 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  36.36 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  35.95 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  35.95 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  35.95 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  35.95 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  35.95 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  35.95 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  38.1 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.87 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>