More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1732 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  100 
 
 		 146 aa  290  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  99.32 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  73.29 
 
 		 145 aa  220  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  81.82 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  78.77 
 
 		 145 aa  197  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  65.07 
 
 		 145 aa  187  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  63.01 
 
 		 145 aa  176  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  68.49 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  60 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  44.52 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  41.38 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  42.07 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  42.07 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  42.07 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  42.07 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  42.07 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  42.07 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  42.07 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  41.38 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  41.38 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  41.38 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  39.31 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 153 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  40.69 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  38.62 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  39.31 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  40 
 
 		 155 aa  94.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  39.04 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  40.67 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  37.33 
 
 		 200 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  46.62 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  40.79 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  40.79 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  37.93 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 145 aa  89.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  38.93 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  40 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  40 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  38.51 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  41.45 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  39.31 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  42.95 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  38 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  36.73 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  40 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  37.16 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  38.1 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  35.81 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  38.36 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  37.24 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  39.46 
 
 		 144 aa  84.3  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  38.16 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  34 
 
 		 187 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  39.6 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  38.78 
 
 		 168 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  35.62 
 
 		 169 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.67 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  39.46 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  36 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  34 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  41.5 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  39.46 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38.93 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  38.67 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  39.46 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  38.41 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  34.46 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  38.1 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  39.04 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  37.25 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  38.78 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  38.78 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  38.78 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.48 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  38.41 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  36.11 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  39.73 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>