More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3368 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  286  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  62.33 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  44.52 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  42.28 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  40.54 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  47.06 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  46.62 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  46.62 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  45.64 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  46.98 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  36.24 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  38.62 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.97 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  36.99 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  35.62 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  37.24 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  38.93 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  39.46 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  37.75 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  37.75 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.64 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  38.36 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  35.62 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  38.26 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  38.26 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  38.26 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  38.26 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  41.5 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  38.26 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  38.26 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  36.13 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  38.26 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  35.62 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  36.91 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  35.62 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  34.93 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  37.93 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  35.86 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  37.93 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  37.93 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  37.93 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  37.93 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  35.62 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  36.49 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  37.93 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  37.93 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  39.86 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  38.16 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  34.93 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  31.51 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  37.5 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  40.14 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  34.46 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  35.81 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  37.5 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  35.57 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.1 
 
 		 180 aa  77  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.25 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  32.45 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  34.46 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.77 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  35.86 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.43 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  36.91 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36.99 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  34.59 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  35.25 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>