More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2068 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  293  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  293  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  293  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  97.92 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  97.22 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  97.22 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  97.22 
 
 		 144 aa  287  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  92.36 
 
 		 144 aa  274  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  92.36 
 
 		 144 aa  274  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  92.36 
 
 		 144 aa  274  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  92.36 
 
 		 144 aa  274  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  92.36 
 
 		 144 aa  274  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  92.36 
 
 		 144 aa  274  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  92.36 
 
 		 144 aa  274  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  92.36 
 
 		 144 aa  274  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  87.5 
 
 		 144 aa  263  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  83.33 
 
 		 144 aa  250  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  83.33 
 
 		 144 aa  248  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  67.36 
 
 		 144 aa  209  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  66.67 
 
 		 144 aa  206  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  65.97 
 
 		 168 aa  206  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  65.97 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  65.97 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  52.78 
 
 		 144 aa  153  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  49.66 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  53.06 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  50.68 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  50.68 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  50.69 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  48.63 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  46.21 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  46.53 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  47.22 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  44.14 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  41.33 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  43.45 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  44.44 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  46.21 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  41.89 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  43.92 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  44.59 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  41.89 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  41.89 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  39.46 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0249  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  41.22 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  40.28 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  42.07 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  34.97 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  38.78 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.42 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  39.69 
 
 		 145 aa  86.7  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  34.46 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  34.46 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  36.91 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  36.91 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3490  universal stress protein  34.25 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.267161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  36.88 
 
 		 181 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  38.16 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  39.04 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  39.6 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  35.57 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  38.62 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  32.21 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  35.33 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  34.03 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.72 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  33.33 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  33.55 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35.46 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  29.53 
 
 		 276 aa  70.5  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.86 
 
 		 164 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  30.82 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.39 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.48 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>